传统的蛋白测序技术高度依赖于已有的蛋白数据库资源。目前大多数测序需要将测得的多肽序列在蛋白或基因组数据库中进行搜索， 再与同源序列进行比对和匹配，然而，由于一些蛋白序列尚未被测序或纳入数据库中，这就往往导致对某些蛋白的无法比对或错误识别。
快序生物开发的从头测序技术(de novo sequencing)，完全不依赖于任何已知的DNA或者蛋白质数据库信息，直接对蛋白质氨基酸 序列进行测定。蛋白从头测序的原理是基于蛋白酶切后的肽段分子在质谱仪中有规律的断裂，找到特定断裂模式，再根据质谱峰之间 质量差即可算出对应的氨基酸信息，以及氨基酸上的翻译后修饰。使用这项技术不仅能揭示全新的未知蛋白序列，还能捕捉到突变位 点信息，从而打破了对传统数据库的依赖，真正踏入了蛋白测序的新纪元。
